La historia de Comoras se remonta a cuando fueron pobladas desde la segunda mitad del primer milenio, las diferentes islas del archipi茅lago de Comores tuvieron una historia muy anexa, aunque no totalmente com煤n. Fue Francia, quien las convirti贸 en parte de su imperio colonial, quien las uni贸 administrativamente. La historia de las islas se separ贸 nuevamente en 1975, despu茅s de que en un refer茅ndum Mayotte optase por quedarse bajo gobierno franc茅s y el resto de islas integrase la Rep煤blica Federal Isl谩mica de Comoras .
Los primeros trazos de poblaci贸n datan del siglo VI y se trata probablemente de bant煤es, provenientes de la costa africana. Estos primeros habitantes crearon en la isla una organizaci贸n pol铆tica y social propiamente africana. Entre los siglos VII y XII se cree que una ola de pueblos austronesianos, que contribuyeron al poblamiento de la isla de Madagascar, pas贸 por la isla, pero no se estableci贸. Inicialmente, los pueblos eran regidos por los jefes de las familias m谩s importantes. 脡stos portaban el t铆tulo de maf茅, mfaume o mafani en Anjouan y Moh茅li (Mfalume en kiunguja).
El sult谩n Saidi Abdallah bin Salim en 1897.El islam hizo aparici贸n en las islas en el siglo XI, como atestiguan las sepulturas de rito musulm谩n descubiertas en Mayotte en la necr贸polis funeraria de Bagamoyo. Arrib贸 sobre todo de la mano de mercaderes de paso que llegaban provenientes de Medio Oriente, de la ciudad de Shiraz, quienes constituyeron las primeras comunidades musulmanas del archipi茅lago. Estas dinast铆as shirazies, originar铆as de la costa suajili fundaron en efecto los primeros sultanatos, unificando bajo su autoridad las comunidades lugare帽as, entonces comandadas por maf茅s, (Anjouan, Moh茅li y Mayotte) y un bedja (Gran Comora). Fue con su contacto que las 茅lites comoresas fueron progresivamente islamiz谩ndose. Se cree que ya en el siglo XII toda la aristrocracia comoresa estaba totalmente islamizada .
La mas antigua mezquita del archipi茅lago se sit煤a en Anjouan, sobre el sitio de la antigua Sima y datar铆a del siglo XII. El Islam practicado a esta fecha estaba muy influenciado por el chiismo y se rescata particularmente su eco en la presencia de sepulturas en el eje del mihrab de numerosas mezquitas antiguas (culto del santo fundador). El islam sunita chafita no se impuso en el sudoeste del Oc茅ano 铆ndico hasta a partir del siglo XIV. Sima se convirti贸 en la capital del sultanato shirazi de Anjouan. Fue en esta 茅poca que se construy贸 la mezquita shirazi, sus ruinas son tod铆a visibles hoy. Domoni fue sede de otra mezquita shirazi a fin del siglo XV. Una inscripci贸n presente en la mezquita del Vendredi de Moroni fecha su construcci贸n en 1427, mientras que en Mbeni, una inscripci贸n fecha la mezquita del Vendredi en 1470.
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