电疗通常是指离子导入、静电疗法、电休克疗法，以及高频、中频、低频脉冲电疗法等。短期应用通常没有较大的危害性和副作用，但如果未在专业医生的指导下长期应用，又由于电疗存在一定的辐射危害性，故可能会出现肌肉神经敏感度下降、内分泌失调、神经节律异常改变等副作用。
1、肌肉神经敏感度下降：长期应用某些局部电疗，长时间可能会对人体局部产生刺激，可导致肌肉神经敏感度下降；
2、内分泌失调：当电疗作用于腺体区时，如甲状腺区，就可能会对人体的内分泌造成影响，长期应用可能会导致内分泌失调；
3、神经节律异常改变：长期做电疗，尤其是在头部进行电疗时，可能会刺激神经，产生神经兴奋，造成神经节律异常改变。患者可能会出现头痛、头晕，可伴有恶心、呕吐等现象，还可能影响睡眠。
此外，长期应用电疗，还可能会出现记忆力减退、注意力不集中、心律失常等副作用。
对于戴心脏起搏器、患有恶性肿瘤、局部有炎症的患者而言，应避免使用电疗进行刺激，以免造成心脏节律异常、肿瘤进一步发展，以及炎症扩散等不良影响。