解脲支原体感染主要采用药物治疗，药物主要是多西环素、利福平、甲硝唑及阿莫西林等。该病需要长期持续性治疗。
治疗周期 解脲支原体感染需要长期持续性治疗。 一般治疗在治疗期间双方绝对禁止性生活，男方需要定期排精，治疗期间规律饮食，多饮水，勤换内裤，保证清洁卫生。
药物治疗 多西环素为广谱抑菌剂，高浓度时具杀菌作用。胃肠道反应多见，如恶心、呕吐、腹泻等，饭后服药可减轻。8岁以下儿童应避免使用多西环素，老年人长期使用对肝有损伤，应慎用。
利福平为利福霉素类半合成广谱抗菌药，对多种病原微生物均有抗菌活性。利福平口服吸收良好，服药后1.5~4小时血药浓度达峰值。消化道反应最为多见，口服该品后可出现厌食、恶心、呕吐、上腹部不适、腹泻等胃肠道反应。肝功能严重不全、胆道阻塞者和3个月以内孕妇禁用。
甲硝唑可用于细菌感染，部分病例出现不良反应，以消化道反应最为常见，包括恶心、呕吐、食欲不振、腹部绞痛，一般不影响治疗；神经系统症状有头痛、眩晕，大剂量可致抽搐。少数病例发生等麻疹、潮红、瘙痒，均属可逆性，停药后自行恢复。有活动性中枢神经系统疾患和血液病者禁用。孕妇及哺乳期妇女禁用。
阿莫西林为β内酰胺类抗生素、青霉素类药，用于治疗各类感染，可见恶心、呕吐、腹泻，及假膜性肠炎等胃肠道反应和皮疹、哮喘等过敏反应。青霉素过敏及青霉素皮肤试验阳性患者禁用。
手术治疗本病一般无需手术治疗。