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四口人用多少升的热水器 蛋白质跨膜区预测

结果分析

跨膜区预测结果中有三个值:Inside、Outside、Transmembrane。

Inside表示胞内区,inside数值越大,表示该氨基酸位于胞内区的可能性越大;

Outside表示胞外区,outside数值越大,表示该氨基酸位于胞外区的可能性越大。

Transmembrane表示跨膜区,Transmembrane数值越大,表示该氨基酸在跨膜区的可能性越大;

注意1:如果某条序列预测结果为Inside或者Outside,那么表明它没有跨膜结构域,此时不应将Inside或者Outside理解为该蛋白的细胞定位。

注意2:有可能会把信号肽区域预测为跨膜区,注意区分;可以先用信号肽预测工具预测信号肽

注意3:不要用该程序来预测蛋白的细胞定位!

参考文献 A. Krogh, B. Larsson, G. von Heijne, and E. L. L. Sonnhammer. Predicting transmembrane protein topology with a hidden Markov model: Application to complete genomes. Journal of Molecular Biology, 305(3):567-580, January 2001.

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