南方科技大学在短短十二年之内迅速成为全球卓越的学校，在成为全球顶尖大学的道路上取得了里程碑式的成就。作为人才储备发展的一部分，南科大聚集了优秀的教师团队，创造了优异的学术和科学成就，不断提升全球声誉及影响力。南科大在科研影响力方面表现突出，以“质”取胜，其出色的科研成果，使南科大能在短时间内在世界大学排名上取得优异的成绩。
最新自然指数排名（时间区段：2021年7月1日-2022年6月30日），南科大位列世界第30位，中国第13位。
南科大物理学、化学、工程学、地球科学、材料科学、计算机科学、环境/生态学、临床医学、免疫学9个学科进入ESI前1%。
（以下为中国内地排名）
泰晤士高等教育大学排名8th
2023泰晤士世界大学排行榜
8th
2022泰晤士亚洲大学排行榜
1st
2022泰晤士年轻大学排行榜
2022泰晤士世界大学学科排名(中国内地排名)7th
生命科学
12th
工程与技术
8th
理学
12th
计算机科学
QS 大学排名11th
中国内地
2023 QS世界大学排行榜
1st
中国内地
2021 QS年轻大学排行榜
US News 大学排名28th
中国内地
2022 US News全球最好大学排行榜
2nd
中国内地
2022 国际合作-相对于国家
软科大学排名35th
中国内地
2022软科中国大学排行榜
14-26th
中国内地
2022软科世界大学学术排行榜
2022中国最好学科排名 (中国内地排名)3rd
地球物理学
14th
力学
15th
物理学