EOS R3的短片记录画质最高达到6K RAW 59.94P/50.00P。水平视角无裁切的6K短片可充分发挥全画幅易获得背景虚化的特点，并充分利用镜头水平视角，为宏大场面等的拍摄提供了便捷。6K影像提供了2倍于4K影像，9倍于全高清影像的画面清晰度，能够为用户提供丰富的影像细节。在6K基础上后期制作4K或全高清影像，可在不压缩画质的基础上通过局部裁切实现摇摄、推拉镜头的效果。新开发的全画幅背照堆栈式CMOS图像感应器实现了信号的高速读取，拍摄视频时大幅减轻了果冻效应。不仅如此，相机具备第二代全像素双核CMOS AF，在拍摄6K短片时也可进行高性能的自动对焦追踪拍摄。配合强有力的机身防抖，为画面效果的清晰稳定提供保障。此外，相机还支持6K/5.6K超采样生成高精细4K短片以及拍摄119.88P/100P（NTSC/PAL）的4K高帧频短片。
无裁切的6K/4K DCI、相当于Super 35mm的4KEOS R3可充分运用35mm全画幅的大型图像感应器，拍摄无裁切的6K、4K DCI视频。除此之外，大型图像感应器还易于拍出广角效果及背景虚化。相机还支持以1.6倍裁切（APS-C裁切）拍摄，相当于一般电影机标准的Super 35mm规格。
新固件1.2.1，性能提升 新增支持全高清239.76P/200.00P高帧频，新增支持4K/全高清延时短片 EOS R3固件升级至版本1.2.1及以上后，进一步提升了短片拍摄性能。全高清下，新增支持拍摄239.76P/200.00P高帧频，可拍摄出高品质的8倍慢动作短片。此外，还新增支持4K/全高清延时短片功能，可通过间隔拍摄压缩时间，表现天上的流云、划过夜空的银河等。短片数码IS在原有5轴防抖的基础上新增倾角校正功能。